Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDC3Q96F86 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDC3Q96F86 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms