Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C18orf8Q96DM3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C18orf8Q96DM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms