Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC47Q96A33 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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