Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.834e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 EHBP1-205ENST00000413434 533 ntTSL 49.84□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)9.72□□□□□ -0.854e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DDB1-225ENST00000545930 1278 ntTSL 29.69□□□□□ -0.864e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-216ENST00000372368 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.884e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.94e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-234ENST00000531993 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.94e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 EHBP1-217ENST00000472809 1374 ntTSL 59.28□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-238ENST00000533997 1007 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.934e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-218ENST00000372372 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-214ENST00000372366 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.954e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.974e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 EHBP1-211ENST00000449820 539 ntTSL 58.92□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-222ENST00000469715 1160 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.994e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-227ENST00000490541 976 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.994e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-236ENST00000533212 781 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.994e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.044e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.044e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-237ENST00000533933 834 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.054e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.064e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.064e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ENPP3-205ENST00000427707 1536 ntTSL 1 (best)7.92□□□□□ -1.144e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 IBTK-202ENST00000369751 4437 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.174e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-224ENST00000484868 318 ntTSL 37.68□□□□□ -1.184e-11■■■■■ 51
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TBRG4Q969Z0 EHBP1-207ENST00000426940 586 ntTSL 47.5□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 51
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TBRG4Q969Z0 CPEB4-205ENST00000519152 441 ntTSL 37.25□□□□□ -1.254e-11■■■■■ 51
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TBRG4Q969Z0 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.294e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.374e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.384e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.32□□□□□ -1.44e-11■■■■■ 51
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TBRG4Q969Z0 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.574e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.589e-7■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.644e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 SORBS1-214ENST00000472854 565 ntTSL 24.72□□□□□ -1.654e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 DDB1-219ENST00000541513 958 ntTSL 44.72□□□□□ -1.654e-11■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 EHBP1-219ENST00000494958 1127 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.73e-6■■■■■ 51
TBRG4Q969Z0 ENPP3-207ENST00000494023 632 ntTSL 33.98□□□□□ -1.774e-11■■■■■ 51
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TBRG4Q969Z0 NFIA-207ENST00000403491 9487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 50.8
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TBRG4Q969Z0 NFIA-202ENST00000371184 1348 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 50.8
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TBRG4Q969Z0 NFIA-206ENST00000371191 1916 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 50.8
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TBRG4Q969Z0 NFIA-208ENST00000407417 2123 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 50.8
TBRG4Q969Z0 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 50.8
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TBRG4Q969Z0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 50.7
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TBRG4Q969Z0 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 50.7
TBRG4Q969Z0 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 50.7
TBRG4Q969Z0 AC105429.1-201ENST00000612833 4001 ntBASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 50.7
TBRG4Q969Z0 ARF4-202ENST00000463880 641 ntTSL 320.44■□□□□ 0.861e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 ARF4-204ENST00000486310 1601 ntTSL 37.04□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 ARF4-203ENST00000483848 404 ntTSL 52.27□□□□□ -2.051e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 RORA-206ENST00000557822 545 ntTSL 414.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 RORA-205ENST00000551975 749 ntTSL 39.78□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 50.6
TBRG4Q969Z0 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 50.4
TBRG4Q969Z0 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 50.4
TBRG4Q969Z0 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 50.4
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 LARGE1-202ENST00000397394 4138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.826e-13■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 50.3
TBRG4Q969Z0 VAV2-205ENST00000486113 523 ntTSL 212.45□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 MAN1B1-203ENST00000474902 2336 ntTSL 215.38■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 50.2
TBRG4Q969Z0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 50.2
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