Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKL1Q969V6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms