Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFKQ969G6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms