Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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