Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RAD50Q92878 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD50Q92878 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms