Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNRQ92752 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNRQ92752 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNRQ92752 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNRQ92752 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNRQ92752 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNRQ92752 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNRQ92752 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNRQ92752 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms