Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TAF4BQ92750 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms