Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF12Q8WXF0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF12Q8WXF0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms