Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DCAF4Q8WV16 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms