Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP133Q8WUM0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP133Q8WUM0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms