Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms