Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC191Q8NCU4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC191Q8NCU4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms