Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSL3Q8N5Y2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms