Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC47Q8N1G4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms