Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP2Q8IXW5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP2Q8IXW5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms