Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NME9Q86XW9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms