Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLNKQ7Z7G1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLNKQ7Z7G1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms