Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms