Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
STRCQ7RTU9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms