Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms