Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPPQ6IPU0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPPQ6IPU0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms