Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VIRMAQ69YN4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VIRMAQ69YN4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms