Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
EEF1DP3Q658K8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1DP3Q658K8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms