Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRAMEF6Q5VXH4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms