Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SAMD13Q5VXD3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms