Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDGFL1Q5TGJ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDGFL1Q5TGJ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms