Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NHSL1Q5SYE7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NHSL1Q5SYE7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms