Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms