Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEXMIFQ5QGS0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEXMIFQ5QGS0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms