Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PCID2Q5JVF3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PCID2Q5JVF3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms