Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms