Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RFTN2Q52LD8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms