Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PCGF3Q3KNV8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCGF3Q3KNV8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms