Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LETM2Q2VYF4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LETM2Q2VYF4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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