Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCB5Q2M3G0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB5Q2M3G0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms