Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC96Q2M329 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms