Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MICAQ29983 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MICAQ29983 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MICAQ29983 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MICAQ29983 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MICAQ29983 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MICAQ29983 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MICAQ29983 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MICAQ29983 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MICAQ29983 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms