Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PDK4Q16654 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK4Q16654 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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