Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NFE2Q16621 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NFE2Q16621 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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