Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FXNQ16595 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FXNQ16595 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FXNQ16595 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FXNQ16595 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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FXNQ16595 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FXNQ16595 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FXNQ16595 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FXNQ16595 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FXNQ16595 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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FXNQ16595 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FXNQ16595 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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