Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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SGCAQ16586 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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