Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USF2Q15853 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USF2Q15853 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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