Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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NEDD8Q15843 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NEDD8Q15843 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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NEDD8Q15843 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NEDD8Q15843 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms