Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHRNA2Q15822 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA2Q15822 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms