Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNHIT3Q15649 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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