Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SEC23BQ15437 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SEC23BQ15437 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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SEC23BQ15437 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SEC23BQ15437 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SEC23BQ15437 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SEC23BQ15437 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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SEC23BQ15437 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SEC23BQ15437 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SEC23BQ15437 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC23BQ15437 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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