Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE3CQ15386 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE3CQ15386 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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